La cofradía cuenta para su gobierno con dos órganos: la asamblea o colegio de hermanos y la Junta Directiva.
La asamblea está compuesta por todos los hermanos que componen la cofradía y se reunirá de forma ordinaria una vez al año para fiscalizar la actividad de la Junta Directiva.
La Junta Directiva es el órgano de Administración, Gobierno y representación de la cofradía y a ella corresponden todos los asuntos no reservados por los estatutos o el Código de Derecho Canónico a la asamblea. Los miembros de la Junta Directiva serán elegidos cada cuatro años y ésta estará compuesta por un mínimo de 6 y un máximo de 15 hermanos.
Actualmente está compuesta de la siguiente forma: